注意事项
1.要长期使用。微生物制剂的预防效果好于治疗效果，其作用发挥较慢，长期使用方能达到预期的效果。
2.要尽早使用。通过先入菌的大量繁殖，形成优势种群，减少或阻碍病原菌的定居。
3.要采用适当的方法及适时使用。有些微生物制剂可全池泼洒，有的作为饲料添加剂，有的可与其他物质混合使用。要选择好投放时间，如光合细菌及硝化细菌投放时最好和沸石粉混合使用；而芽孢杆菌则须在水瘦时使用，因其能迅速利用大分子有机物质，同时能将有机物质矿化生成无机盐，从而为单细胞藻类繁殖提供营养，维持稳定的水色。
4.禁止与抗生素、消毒杀菌药或具有抗菌作用的中草药同时使。
5.施用时注意菌体活力及菌体数量。一般要求含每毫升3亿个以上的活菌体，且活力强，同时注意制剂的保存期，随着保存期的延长，活菌数量逐渐减少，故保存期不宜过长，并且打开包装后尽快使用。
6.有的微生物制剂在使用前要活化培养。活化能让微生物迅速“复活”，活菌数量成倍增加，也能使菌迅速适应池塘水质条件，如芽孢杆菌使用前要采用本池水加上少量的红糖或蜂蜜，浸泡4小时～5小时后即可泼洒，这样活化的芽孢杆菌繁殖速度快，可提高使用效率。
7.注意一些不利因素的影响。如温度、pH值。硝化细菌在pH值低于7或高于8.5的水体中繁殖速度会受到一定的影响，最适范围为7.8～8.2，所以要控制好水体中的pH值，以利于有益微生物的生长。
